MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. JM

Total Repeats: 31148

< Previous12...51525354555657585960616263Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_021880	CCA	2	6	1474600	1474605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526463465
31002	NC_021880	CTC	2	6	1474622	1474627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526463465
31003	NC_021880	T	6	6	1474628	1474633	0 %	100 %	0 %	0 %	526463465
31004	NC_021880	ACG	2	6	1474652	1474657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526463465
31005	NC_021880	GCT	2	6	1474658	1474663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526463465
31006	NC_021880	GTT	2	6	1474666	1474671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526463465
31007	NC_021880	CTC	2	6	1474701	1474706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526463465
31008	NC_021880	AGG	2	6	1474713	1474718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526463465
31009	NC_021880	CAA	2	6	1474766	1474771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526463465
31010	NC_021880	CTC	3	9	1474773	1474781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526463465
31011	NC_021880	GGC	2	6	1474786	1474791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526463465
31012	NC_021880	GCG	2	6	1474841	1474846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526463465
31013	NC_021880	GGT	2	6	1474864	1474869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526463465
31014	NC_021880	TCCT	2	8	1474915	1474922	0 %	50 %	0 %	50 %	526463465
31015	NC_021880	CTTC	2	8	1474934	1474941	0 %	50 %	0 %	50 %	526463465
31016	NC_021880	GAA	3	9	1474998	1475006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526463465
31017	NC_021880	A	6	6	1475005	1475010	100 %	0 %	0 %	0 %	526463465
31018	NC_021880	CAC	2	6	1475037	1475042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526463465
31019	NC_021880	CTT	2	6	1475058	1475063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526463465
31020	NC_021880	CTA	2	6	1475078	1475083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463465
31021	NC_021880	GCT	2	6	1475112	1475117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526463465
31022	NC_021880	CTA	2	6	1475149	1475154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31023	NC_021880	CTAA	2	8	1475165	1475172	50 %	25 %	0 %	25 %	526463466
31024	NC_021880	AAG	2	6	1475261	1475266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526463466
31025	NC_021880	T	7	7	1475285	1475291	0 %	100 %	0 %	0 %	526463466
31026	NC_021880	CTT	2	6	1475297	1475302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526463466
31027	NC_021880	CAT	2	6	1475365	1475370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463466
31028	NC_021880	CCA	2	6	1475409	1475414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526463466
31029	NC_021880	CAT	2	6	1475458	1475463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463466
31030	NC_021880	AGG	2	6	1475489	1475494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526463466
31031	NC_021880	GCA	2	6	1475619	1475624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526463466
31032	NC_021880	ATCAA	2	10	1475652	1475661	60 %	20 %	0 %	20 %	526463466
31033	NC_021880	TTG	2	6	1475739	1475744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526463466
31034	NC_021880	CTA	2	6	1475892	1475897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463466
31035	NC_021880	TCA	2	6	1476004	1476009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463466
31036	NC_021880	AG	3	6	1476076	1476081	50 %	0 %	50 %	0 %	526463467
31037	NC_021880	TC	3	6	1476112	1476117	0 %	50 %	0 %	50 %	526463467
31038	NC_021880	CCT	2	6	1476175	1476180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526463467
31039	NC_021880	AG	3	6	1476193	1476198	50 %	0 %	50 %	0 %	526463467
31040	NC_021880	ACA	2	6	1476220	1476225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526463467
31041	NC_021880	TAG	2	6	1476325	1476330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463467
31042	NC_021880	TTG	2	6	1476343	1476348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526463467
31043	NC_021880	AAT	2	6	1476389	1476394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526463467
31044	NC_021880	TCG	2	6	1476406	1476411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526463467
31045	NC_021880	CTT	2	6	1476462	1476467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526463467
31046	NC_021880	ACA	2	6	1476554	1476559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526463467
31047	NC_021880	AAG	3	9	1476564	1476572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526463467
31048	NC_021880	T	10	10	1476670	1476679	0 %	100 %	0 %	0 %	526463467
31049	NC_021880	CAT	2	6	1476768	1476773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31050	NC_021880	CTA	2	6	1476780	1476785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31051	NC_021880	TTTA	2	8	1476790	1476797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31052	NC_021880	CTT	2	6	1476820	1476825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31053	NC_021880	AAGA	2	8	1476939	1476946	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31054	NC_021880	T	6	6	1476951	1476956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31055	NC_021880	TAT	2	6	1476962	1476967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31056	NC_021880	CAA	2	6	1476980	1476985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31057	NC_021880	CTATA	2	10	1476988	1476997	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31058	NC_021880	CA	3	6	1477002	1477007	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31059	NC_021880	TA	3	6	1477025	1477030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31060	NC_021880	GTAC	2	8	1477056	1477063	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31061	NC_021880	ATG	2	6	1477138	1477143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31062	NC_021880	ACT	2	6	1477168	1477173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31063	NC_021880	AGA	2	6	1477274	1477279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31064	NC_021880	ATA	2	6	1477328	1477333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31065	NC_021880	AGA	2	6	1477506	1477511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464094
31066	NC_021880	CAA	2	6	1477526	1477531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464094
31067	NC_021880	TAG	2	6	1477557	1477562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464094
31068	NC_021880	CTA	2	6	1477568	1477573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464094
31069	NC_021880	T	6	6	1477577	1477582	0 %	100 %	0 %	0 %	526464094
31070	NC_021880	CTA	2	6	1477598	1477603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464094
31071	NC_021880	CGG	2	6	1477616	1477621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526464094
31072	NC_021880	GTTT	2	8	1477632	1477639	0 %	75 %	25 %	0 %	526464094
31073	NC_021880	CT	3	6	1477654	1477659	0 %	50 %	0 %	50 %	526464094
31074	NC_021880	C	6	6	1477762	1477767	0 %	0 %	0 %	100 %	526464094
31075	NC_021880	CA	4	8	1477796	1477803	50 %	0 %	0 %	50 %	526464094
31076	NC_021880	TGC	2	6	1477871	1477876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464094
31077	NC_021880	AGC	2	6	1477977	1477982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464094
31078	NC_021880	AAC	2	6	1478007	1478012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464094
31079	NC_021880	TAG	2	6	1478034	1478039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464094
31080	NC_021880	CAC	2	6	1478132	1478137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464094
31081	NC_021880	TGT	2	6	1478177	1478182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464094
31082	NC_021880	GT	3	6	1478207	1478212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31083	NC_021880	TG	3	6	1478225	1478230	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31084	NC_021880	TC	3	6	1478282	1478287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31085	NC_021880	TA	3	6	1478309	1478314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31086	NC_021880	ATA	2	6	1478320	1478325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31087	NC_021880	TAA	2	6	1478332	1478337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31088	NC_021880	GGC	2	6	1478489	1478494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31089	NC_021880	AAAG	2	8	1478527	1478534	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31090	NC_021880	CAT	2	6	1478535	1478540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31091	NC_021880	TAC	2	6	1478543	1478548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31092	NC_021880	T	6	6	1478558	1478563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31093	NC_021880	GAA	2	6	1478600	1478605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31094	NC_021880	GTT	3	9	1478640	1478648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526463468
31095	NC_021880	AAT	2	6	1478739	1478744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526463468
31096	NC_021880	ACT	2	6	1478895	1478900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463468
31097	NC_021880	CAA	2	6	1478903	1478908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526463468
31098	NC_021880	T	8	8	1478913	1478920	0 %	100 %	0 %	0 %	526463468
31099	NC_021880	GTA	2	6	1478959	1478964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463468
31100	NC_021880	TAG	2	6	1479042	1479047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463468
31101	NC_021880	CT	3	6	1479061	1479066	0 %	50 %	0 %	50 %	526463468
31102	NC_021880	GAA	2	6	1479100	1479105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526463468
31103	NC_021880	TCC	2	6	1479187	1479192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526463468
31104	NC_021880	T	8	8	1479236	1479243	0 %	100 %	0 %	0 %	526463468
31105	NC_021880	AT	3	6	1479299	1479304	50 %	50 %	0 %	0 %	526463468
31106	NC_021880	A	6	6	1479318	1479323	100 %	0 %	0 %	0 %	526463468
31107	NC_021880	CAA	2	6	1479348	1479353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526463468
31108	NC_021880	ATGTA	2	10	1479399	1479408	40 %	40 %	20 %	0 %	526463468
31109	NC_021880	T	8	8	1479454	1479461	0 %	100 %	0 %	0 %	526463468
31110	NC_021880	TGT	2	6	1479500	1479505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526463468
31111	NC_021880	TTG	2	6	1479524	1479529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526463468
31112	NC_021880	TGCA	2	8	1479541	1479548	25 %	25 %	25 %	25 %	526463468
31113	NC_021880	T	7	7	1479800	1479806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31114	NC_021880	CAAG	2	8	1479919	1479926	50 %	0 %	25 %	25 %	526464095
31115	NC_021880	AT	3	6	1479946	1479951	50 %	50 %	0 %	0 %	526464095
31116	NC_021880	GC	3	6	1479962	1479967	0 %	0 %	50 %	50 %	526464095
31117	NC_021880	ATA	2	6	1479996	1480001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31118	NC_021880	CTG	2	6	1480022	1480027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31119	NC_021880	ATT	2	6	1480040	1480045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31120	NC_021880	ATA	2	6	1480080	1480085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31121	NC_021880	ACT	2	6	1480208	1480213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31122	NC_021880	AAGT	2	8	1480256	1480263	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31123	NC_021880	ACT	2	6	1480310	1480315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31124	NC_021880	TGT	2	6	1480371	1480376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31125	NC_021880	CAG	2	6	1480387	1480392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31126	NC_021880	ATA	2	6	1480423	1480428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31127	NC_021880	TAA	2	6	1480460	1480465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31128	NC_021880	CAT	2	6	1480491	1480496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31129	NC_021880	ACA	2	6	1480514	1480519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31130	NC_021880	TA	3	6	1480567	1480572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31131	NC_021880	A	7	7	1480620	1480626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31132	NC_021880	ATA	2	6	1480723	1480728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31133	NC_021880	GCA	2	6	1480729	1480734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31134	NC_021880	A	6	6	1480757	1480762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31135	NC_021880	CAC	2	6	1480771	1480776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31136	NC_021880	AAT	2	6	1480891	1480896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31137	NC_021880	TAA	2	6	1480982	1480987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31138	NC_021880	GT	3	6	1481035	1481040	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31139	NC_021880	GT	5	10	1481043	1481052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31140	NC_021880	A	6	6	1481108	1481113	100 %	0 %	0 %	0 %	526464096
31141	NC_021880	CCA	2	6	1481178	1481183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464096
31142	NC_021880	TTGCC	2	10	1481306	1481315	0 %	40 %	20 %	40 %	526464096
31143	NC_021880	GAAC	2	8	1481370	1481377	50 %	0 %	25 %	25 %	526464096
31144	NC_021880	TGA	2	6	1481405	1481410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464096
31145	NC_021880	GC	3	6	1481420	1481425	0 %	0 %	50 %	50 %	526464096
31146	NC_021880	TGC	2	6	1481523	1481528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464096
31147	NC_021880	AACT	3	12	1481538	1481549	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31148	NC_021880	TTA	3	9	1481575	1481583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...51525354555657585960616263Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.